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三只果蝇的真实连线:共享的结构,大半是嗅小球层面的输入总量
English overview →配合仿真与实验探针的假设探索,等待更多证据或边界检验。
数字花园
🌿 什么是数字花园与思想演进?
遵循 Maggie Appleton 与 Andy Matuschak 的常青笔记理念:这里不是按时间沉底的流水账,而是持续修剪打磨的知识生态。文章按成熟度经历:
- 🌱 萌芽 (Seedling): 发散灵感、读书摘录、开放猜想
- 🌿 演进 (Budding): 结构渐明、初步代码推导、积极修正
- 🌳 常青 (Evergreen): 逻辑闭环、持久经得起检验的基石
- 🔬 实验待证 (Speculative): 结合沙盒与仿真探针的理论探索
项目代码与全部实验记录:https://github.com/meiluosi/fly-connectome-study(目录 fly-v4/)
前面所有实验都用同一个个体(MaleCNS 的右半球)的连线。“真实连线有用”如果成立,应该在不同个体之间保持:一只果蝇的连线,替另一只果蝇的任务做学生,也该比随机连线好。这一篇用三只果蝇、五个半球检验这件事。
1. 数据:三个数据集,65 个嗅小球对齐
| 半球 | 来源 | 性别 | 说明 |
|---|---|---|---|
| M_R、M_L | MaleCNS | 雄 | 左右半球 |
| F_R、F_L | FlyWire(v783) | 雌 | 左右半球 |
| H_R | hemibrain v1.2 | 雌 | 只有右半球;1927 个 KC,其中 1801 个有 PN 输入 |
嗅小球按 MaleCNS 的 65 个对齐:嗅小球名取 PN 类型名下划线之前的前缀。FlyWire 缺 2 到 3 个小球,hemibrain 覆盖 65 个中的 62 个。每个 KC 的平均总突触权重在 MaleCNS 约 97,hemibrain 约 91,FlyWire 约 57 到 69,三套数据的突触检测方法不同,数值不能直接比。
hemibrain 数据(45,872,577 字节,Janelia FlyEM,CC BY 4.0)下载后单独放在一个目录,不进代码库。
2. 设计:教师是一个个体,学生是另一个个体
教师—学生任务:标签由教师个体的连线产生,学生是另一个个体的真实连线,对照是:
- 随机稀疏连线: 每个 KC 随机取 6 个嗅小球,权重 1;
- 保留输入总量的对照(marg): 保持该学生每个 KC 的度数和权重,嗅小球按学生所在半球的嗅小球总权重比例抽取。它去掉的是“哪个 KC 接哪几个嗅小球”的细节,只保留“哪些嗅小球被用得多”。
为了让所有连线同样大小,每个半球随机取同样数量的 KC。
3. 结果:比随机好一点,与“只保留输入总量”相当
- 另一只果蝇的真实连线做学生,比随机稀疏连线好 +0.010 到 +0.036,其中大多数低于 0.03。
- 与保留输入总量的对照相比,差在 −0.009 到 +0.006 之间,基本相当;有两个对比是负的。所以跨个体共享的、对任务有用的结构,主要是嗅小球层面的输入总量。
- 真实气味任务(真实气味 + 随机类别标签)上,各半球、保留输入总量的对照和随机稀疏连线彼此在 0.01 以内。
4. 稳健性:数值依赖 KC 数
独立重新实现者只拿到文字说明,用 1800 个 KC,得到的跨个体优势比第一次实验(2018 个 KC)小 2 到 4 倍:雄教师配雌学生,+0.036 对 +0.010;雌教师配雄学生,+0.027 对 +0.019。加入 hemibrain 之后的实验(1801 个 KC)的数值(+0.012 到 +0.026)与重新实现的量级相符。方向在三套实现里都一致,量级不是稳定的,不能引用其中某一个数。
“同一只果蝇的另一半球更好”在雄教师上没有复现,在雌教师上复现了。
5. 文献:结构化连线与个体差异
- Zheng 等 2022 在 FAFB 里报告了结构化的非随机 PN→KC 连线:一个对食物有响应的 PN 核心群落,z = 13.8,但把局部位置信息保留的随机零模型几乎抹去这个效应;在他们的区分模型里,随机嗅小球网络表现最好。
- Caron 等 2013 的检验功效有限,不能当作“连线是随机的”的证据。
- “嗅小球层面的输入总量在个体间保持”没有直接的文献来源,这里是本项目自己的数据结果;不同数据集的每个 KC 平均嗅小球数也不同(FAFB 5.2,hemibrain 5.6,Caron 7)。
所以这里的零结果是关于任务表现的,不是关于连线是否随机。
6. 局限:个体、数据与对照
- 只有三只果蝇、两种性别;三套数据的突触检测方法不同。
- 教师—学生任务衡量的是与教师连线的一致程度,不是自然适应性。
- KC 的身份在个体之间无法对齐,只能比较统计结构,不能比较 KC 对 KC。
- “保留输入总量”的对照同时保留了度数和权重的异质性,三者没有拆开。
7. 下一篇
第 9 篇:隔间与多巴胺。
文件位置:fly-v4/PREREG_v4_stage3.md、PREREG_v4_stage3b.md、NOTES_v4_stage3.md、NOTES_v4_stage3b.md、verification/replication/COMPARISON_3_4.md、build_hemibrain.py。
文章概念网络
从章节进入正文概念。实线表示所属层级,虚线连接跨章节重复出现的概念,不代表因果关系。
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三只果蝇的真实连线:共享的结构,大半是嗅小球层面的输入总量
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引用本文
@article{2026-10-21-fly-connectome-08-individual-differences,
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