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阳性对照与自然气味:能检出连线的作用,却没有测出它在自然气味上的优势
English overview →配合仿真与实验探针的假设探索,等待更多证据或边界检验。
数字花园
🌿 什么是数字花园与思想演进?
遵循 Maggie Appleton 与 Andy Matuschak 的常青笔记理念:这里不是按时间沉底的流水账,而是持续修剪打磨的知识生态。文章按成熟度经历:
- 🌱 萌芽 (Seedling): 发散灵感、读书摘录、开放猜想
- 🌿 演进 (Budding): 结构渐明、初步代码推导、积极修正
- 🌳 常青 (Evergreen): 逻辑闭环、持久经得起检验的基石
- 🔬 实验待证 (Speculative): 结合沙盒与仿真探针的理论探索
项目代码与全部实验记录:https://github.com/meiluosi/fly-connectome-study(目录 fly-v4/)
前六篇的共同缺口是没有阳性对照:任务里并没有确认“连线真的有作用时,这套比较流程能不能检出”。这一篇补上它,再换到自然气味上重测一次。两个问题:流程能检出连线的作用吗?在自然气味的统计上,真实连线有没有表示优势?
1. 问题:没有阳性对照的“没有效应”不能写
“没有测出差别”有两种来源:连线确实没有作用,或者检验本来就看不到。只有先证明检验能看到一个已知存在的作用,“没有差别”才有分量。判定规则沿用第 2 篇:对世界做自助法,三档判定(有意义、小但真实、等价),最小有意义效应取 0.03 个准确率点。
2. 缺陷:第一版阳性对照是循环的
第一版用教师—学生任务:标签由一个带真实连线的蘑菇体教师产生,学生是真实、打乱、随机稀疏三种连线。真实学生比另外两个高约 +0.08,达到了预设的门槛。
独立审查指出这个结果是循环的:教师用的就是真实学生拥有的那套特征,真实学生赢,只因为它拿到了教师的特征。它证明的是“检验能检出一个特征匹配的学生”,不是“检验能检出连线对自然任务的作用”。同一个问题也出现在用真实连线教师给真实气味打标签的任务里。
同一轮审查还发现两个指标有错:KC 沉默的做法让被沉默的 KC 相当于“最大抑制”而不是“缺失”,“50 次后准确率”实际读的是第 40 次。两处在下一轮登记里修正,旧结果保留并标注作废。
3. 非循环对照:教师和学生不再共享同一个实例
新的阳性对照让教师连线不等于任何一个学生的连线:
- 教师被重排 30%: 教师是真实连线,但每个 KC 有 30% 的输入边被挪到别的嗅小球。真实学生拿到的是大体一致的连线,打乱和随机稀疏学生没有。
- 教师是新抽的打乱连线: 学生里的打乱连线是另一个实例,只共享统计类别(度数与突触数分布)。
- 教师被重排 30% 时,真实学生比打乱学生高 +0.064,比随机稀疏高 +0.066(99.2% 区间的下界都超过 0.03)。流程能检出连线实例上的作用。
- 教师只共享统计类别时,打乱对随机稀疏是 +0.001(等价),打乱对真实是 +0.018。连线的统计类别匹配没有带来可测出的优势。
- 独立重新实现: 另一个子 agent 只拿到模型和任务的文字说明,不看原代码和结果,写出了自己的实现,得到 +0.065、+0.064、−0.002、+0.020,都在原区间内。这排除了代码细节造成的假象。
4. 自然气味:用 DoOR 的响应向量做表示层检验
用 DoOR 2.0 的 301 个气味分子 × 65 个嗅小球的响应向量,不涉及奖励规则,也没有教师,所以没有“匹配”可以利用。KC 编码取前 5%,两个任务:
- 少样本类别分类: 9 个化学类别,每类取 2 或 5 个分子做训练,最近质心分类,指标是平衡准确率,随机水平约 0.11。
- 近邻保留: 150 个气味分子的 5 近邻,在 KC 编码空间与 DoOR 空间之间的重合比例。
- 类别分类上,真实连线最多比打乱和随机稀疏连线高约 0.02(5-shot 对随机稀疏 +0.020,区间 [+0.002, +0.040]),没到 0.03。
- 近邻保留上,真实连线比打乱连线略差(−0.026)。
- 扩张加稀疏化并不比直接用 65 维向量好:2-shot 上直接用向量还略高,5-shot 上相当。
5. 结论:能检出作用,没测出自然气味上的优势
- 能说: 流程在连线实例真的起作用时能检出它;在自然气味的类别分类和近邻保留上,没有测出真实连线的表示优势。
- 不能说: 真实连线对自然气味没有意义。DoOR 只覆盖约 47 个嗅小球,缺测的按 0 处理,气味向量偏稀疏;72 个分子没有类别标签;类别分类用的是最近质心,不是学习到的读出。
- 这一轮没有给化学类别指定“生态效价”。文献综述没有找到可核实的类别效价表,随机类别效价在前面的实验里已经检验过(各连线等价)。
6. 局限:阳性对照与数据的边界
- 阳性对照是教师—学生任务,衡量的是和教师连线的一致程度,不是自然适应性;30% 的重排只测了一档。
- 重新实现者和原实现者是同一个模型家族,用的是同一份数据和同一份文字说明。
- 自然气味检验只有一个数据集、一个编码规则。
7. 下一篇
第 8 篇:个体差异。
文件位置:fly-v4/PREREG_v4_stage0b.md、PREREG_v4_stage7.md、NOTES_v4_stage0.md、NOTES_v4_stage7.md、verification/replication/COMPARISON_0b.md。图由 blog/figures/make_figures2.py 生成。
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阳性对照与自然气味:能检出连线的作用,却没有测出它在自然气味上的优势
回到原文 ↗最后更新于 2026-10-21
引用本文
@article{2026-10-21-fly-connectome-07-positive-controls-natural-odours,
author = {枫语},
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